MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Buchnera aphidicola str. Ak (Acyrthosiphon kondoi) plasmid pLeu

Total Repeats: 251

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017257	A	7	7	13	19	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017257	TA	4	8	32	39	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017257	T	7	7	52	58	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017257	TTA	2	6	73	78	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017257	T	7	7	83	89	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_017257	TAT	2	6	120	125	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017257	AAG	2	6	128	133	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017257	A	8	8	142	149	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017257	GCAT	2	8	152	159	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
10	NC_017257	A	16	16	166	181	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_017257	ATT	2	6	187	192	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_017257	T	6	6	197	202	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017257	A	7	7	219	225	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017257	A	6	6	250	255	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_017257	A	7	7	310	316	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017257	AAT	2	6	321	326	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017257	ATA	3	9	367	375	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384228017
18	NC_017257	T	7	7	391	397	0 %	100 %	0 %	0 %	384228017
19	NC_017257	CTT	2	6	474	479	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384228017
20	NC_017257	TTC	3	9	509	517	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384228017
21	NC_017257	ATCA	2	8	595	602	50 %	25 %	0 %	25 %	384228017
22	NC_017257	ATCC	2	8	644	651	25 %	25 %	0 %	50 %	384228017
23	NC_017257	TTG	2	6	655	660	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384228017
24	NC_017257	T	6	6	661	666	0 %	100 %	0 %	0 %	384228017
25	NC_017257	T	8	8	679	686	0 %	100 %	0 %	0 %	384228017
26	NC_017257	A	6	6	706	711	100 %	0 %	0 %	0 %	384228017
27	NC_017257	T	7	7	768	774	0 %	100 %	0 %	0 %	384228017
28	NC_017257	TAAT	2	8	810	817	50 %	50 %	0 %	0 %	384228017
29	NC_017257	TTA	2	6	839	844	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384228017
30	NC_017257	GAA	2	6	914	919	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384228017
31	NC_017257	TCT	2	6	985	990	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384228017
32	NC_017257	A	6	6	1034	1039	100 %	0 %	0 %	0 %	384228017
33	NC_017257	AAG	2	6	1101	1106	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384228017
34	NC_017257	TAT	2	6	1116	1121	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384228017
35	NC_017257	T	6	6	1121	1126	0 %	100 %	0 %	0 %	384228017
36	NC_017257	GGT	2	6	1127	1132	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384228017
37	NC_017257	A	6	6	1135	1140	100 %	0 %	0 %	0 %	384228017
38	NC_017257	TA	3	6	1156	1161	50 %	50 %	0 %	0 %	384228017
39	NC_017257	TAG	2	6	1196	1201	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
40	NC_017257	T	6	6	1241	1246	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_017257	T	6	6	1258	1263	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_017257	AT	3	6	1274	1279	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_017257	ACTTT	2	10	1280	1289	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
44	NC_017257	T	14	14	1287	1300	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_017257	AATA	2	8	1304	1311	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_017257	AAAAG	2	10	1321	1330	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
47	NC_017257	ATT	2	6	1352	1357	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_017257	TTA	2	6	1370	1375	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_017257	A	6	6	1383	1388	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_017257	T	6	6	1397	1402	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_017257	ATGTA	2	10	1403	1412	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
52	NC_017257	GATTT	2	10	1427	1436	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
53	NC_017257	ATA	3	9	1446	1454	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_017257	A	7	7	1482	1488	100 %	0 %	0 %	0 %	384228018
55	NC_017257	A	6	6	1492	1497	100 %	0 %	0 %	0 %	384228018
56	NC_017257	A	6	6	1504	1509	100 %	0 %	0 %	0 %	384228018
57	NC_017257	TA	3	6	1511	1516	50 %	50 %	0 %	0 %	384228018
58	NC_017257	TAT	2	6	1570	1575	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384228018
59	NC_017257	T	6	6	1587	1592	0 %	100 %	0 %	0 %	384228018
60	NC_017257	CAA	2	6	1593	1598	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384228018
61	NC_017257	TATT	2	8	1603	1610	25 %	75 %	0 %	0 %	384228018
62	NC_017257	TAG	2	6	1651	1656	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384228018
63	NC_017257	TAG	2	6	1681	1686	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384228018
64	NC_017257	ATT	2	6	1691	1696	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384228018
65	NC_017257	A	6	6	1759	1764	100 %	0 %	0 %	0 %	384228018
66	NC_017257	GGAT	2	8	1770	1777	25 %	25 %	50 %	0 %	384228018
67	NC_017257	A	6	6	1802	1807	100 %	0 %	0 %	0 %	384228018
68	NC_017257	TCT	2	6	1836	1841	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384228018
69	NC_017257	A	6	6	1873	1878	100 %	0 %	0 %	0 %	384228018
70	NC_017257	AT	3	6	1949	1954	50 %	50 %	0 %	0 %	384228018
71	NC_017257	TTC	2	6	1981	1986	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384228018
72	NC_017257	T	6	6	1995	2000	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_017257	A	6	6	2005	2010	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_017257	TAA	2	6	2011	2016	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_017257	T	7	7	2026	2032	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_017257	TA	3	6	2043	2048	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_017257	TTC	2	6	2093	2098	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_017257	ATTT	2	8	2108	2115	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_017257	GT	3	6	2129	2134	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
80	NC_017257	A	6	6	2146	2151	100 %	0 %	0 %	0 %	384228019
81	NC_017257	TA	5	10	2153	2162	50 %	50 %	0 %	0 %	384228019
82	NC_017257	A	7	7	2198	2204	100 %	0 %	0 %	0 %	384228019
83	NC_017257	ATTT	2	8	2212	2219	25 %	75 %	0 %	0 %	384228019
84	NC_017257	A	6	6	2231	2236	100 %	0 %	0 %	0 %	384228019
85	NC_017257	TAAAT	2	10	2263	2272	60 %	40 %	0 %	0 %	384228019
86	NC_017257	TAAA	2	8	2331	2338	75 %	25 %	0 %	0 %	384228019
87	NC_017257	TAT	2	6	2381	2386	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384228019
88	NC_017257	TAA	2	6	2470	2475	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384228019
89	NC_017257	TAA	2	6	2499	2504	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384228019
90	NC_017257	A	7	7	2540	2546	100 %	0 %	0 %	0 %	384228019
91	NC_017257	A	7	7	2579	2585	100 %	0 %	0 %	0 %	384228019
92	NC_017257	T	7	7	2586	2592	0 %	100 %	0 %	0 %	384228019
93	NC_017257	T	6	6	2603	2608	0 %	100 %	0 %	0 %	384228019
94	NC_017257	AAAT	2	8	2634	2641	75 %	25 %	0 %	0 %	384228019
95	NC_017257	TAA	2	6	2653	2658	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384228019
96	NC_017257	A	8	8	2672	2679	100 %	0 %	0 %	0 %	384228019
97	NC_017257	ATA	2	6	2720	2725	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384228019
98	NC_017257	A	6	6	2739	2744	100 %	0 %	0 %	0 %	384228019
99	NC_017257	ATTA	2	8	2774	2781	50 %	50 %	0 %	0 %	384228019
100	NC_017257	A	8	8	2825	2832	100 %	0 %	0 %	0 %	384228019
101	NC_017257	GATA	2	8	2833	2840	50 %	25 %	25 %	0 %	384228019
102	NC_017257	TA	3	6	2865	2870	50 %	50 %	0 %	0 %	384228019
103	NC_017257	A	9	9	2870	2878	100 %	0 %	0 %	0 %	384228019
104	NC_017257	ATA	3	9	2881	2889	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384228019
105	NC_017257	TCA	2	6	2909	2914	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
106	NC_017257	A	6	6	2927	2932	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_017257	T	6	6	2933	2938	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_017257	TGA	2	6	2951	2956	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
109	NC_017257	ATTT	2	8	2973	2980	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_017257	TTA	2	6	2981	2986	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_017257	ATT	2	6	3000	3005	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_017257	TTA	2	6	3037	3042	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384228020
113	NC_017257	AGCA	2	8	3070	3077	50 %	0 %	25 %	25 %	384228020
114	NC_017257	CAAG	2	8	3081	3088	50 %	0 %	25 %	25 %	384228020
115	NC_017257	TCA	2	6	3171	3176	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384228020
116	NC_017257	A	6	6	3218	3223	100 %	0 %	0 %	0 %	384228020
117	NC_017257	T	7	7	3316	3322	0 %	100 %	0 %	0 %	384228020
118	NC_017257	A	6	6	3356	3361	100 %	0 %	0 %	0 %	384228020
119	NC_017257	ATA	2	6	3375	3380	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384228020
120	NC_017257	T	6	6	3391	3396	0 %	100 %	0 %	0 %	384228020
121	NC_017257	AAAG	2	8	3401	3408	75 %	0 %	25 %	0 %	384228020
122	NC_017257	TAG	2	6	3452	3457	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384228020
123	NC_017257	TAA	2	6	3496	3501	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384228020
124	NC_017257	TAA	2	6	3568	3573	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384228020
125	NC_017257	TTTG	2	8	3581	3588	0 %	75 %	25 %	0 %	384228020
126	NC_017257	ATG	2	6	3634	3639	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384228020
127	NC_017257	CAGG	2	8	3678	3685	25 %	0 %	50 %	25 %	384228020
128	NC_017257	AGA	2	6	3746	3751	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384228020
129	NC_017257	AGA	2	6	3776	3781	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384228020
130	NC_017257	CTA	2	6	3796	3801	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384228020
131	NC_017257	ATT	2	6	3837	3842	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384228020
132	NC_017257	TAA	2	6	3872	3877	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384228020
133	NC_017257	TAG	2	6	3883	3888	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384228020
134	NC_017257	TTC	2	6	3908	3913	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384228020
135	NC_017257	TCA	2	6	3920	3925	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384228020
136	NC_017257	A	6	6	3938	3943	100 %	0 %	0 %	0 %	384228020
137	NC_017257	AGA	2	6	3945	3950	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384228020
138	NC_017257	TAG	2	6	3971	3976	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384228020
139	NC_017257	A	7	7	4062	4068	100 %	0 %	0 %	0 %	384228020
140	NC_017257	TGC	2	6	4094	4099	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384228020
141	NC_017257	T	6	6	4100	4105	0 %	100 %	0 %	0 %	384228020
142	NC_017257	AGCATT	2	12	4151	4162	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	384228020
143	NC_017257	TAA	2	6	4166	4171	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384228020
144	NC_017257	CAA	2	6	4173	4178	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384228020
145	NC_017257	T	6	6	4206	4211	0 %	100 %	0 %	0 %	384228020
146	NC_017257	ATT	2	6	4256	4261	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384228020
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.